Junior perdió 2-1 con América de Cali en la ida de los cuartos de final de la Copa Colombia 2025. El tanto del Tiburón fue obra de Cristian Javier Báez, quien de cabeza descontó a los 82 minutos en el estadio Metropolitano de Barranquilla. El ex Guaraní, Libertad y Cerro Porteño convirtió por tercera vez en el certamen y por quinta ocasión en el año.
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